Thiomargarita magnifica-k 16S rRN markatzaile filogenetiko prokariotikoa erakusten du. Eukarioto bat balitz , tipifikazio filogenetikoak 18S rRNA gene-sekuentziaren presentzia agerian utziko luke (eukariotoen markatzailea). T. magnifica zelula eukarioto bihurtu den konplexutasuna hartuz eboluzionatu izanak prokariotoaren ideia tradizionala zalantzan jartzen du. Hala ere, T. magnifica prokarioto bat da, bakterio handiena.
2009an izan zen zientzialariek naturan dagoen mikrobio-aniztasunarekin topaketa bitxi bat izan zutenean. Karibe itsasoaren hegoaldeko uhartedi batean, Guandelupeko sufrean aberatsak diren mangladi-sedimentuetan sufre-oxidatzaile sinbionteak bilatzen ari zirela, ikerketa-taldeak sedimentuei lotutako harizpi zuri batzuk aurkitu zituen. Handiak ziren, harizpi asko zituztenak, beraz, hasieran ikertzaileak eukariotoak zirela pentsatu zuen, harizpi-onddo ezezagun batzuk . Hala ere, mikroskopia-azterketek zelulabakarrak zirela adierazi zuten, sufre-oxidatzaile batzuk, 'makro' mikrobioak. Onddoak balira, orduan tipifikazio filogenetikoak 18S rRNA gene-sekuentzia agerian utzi beharko luke ( eukariotoen markatzaile bat ). Hala ere, geneen sekuentziazioak 16S rRNA prokariotoen markatzailearen presentzia agerian utzi zuen, eta horrek esan nahi du lagina Thiomargarita generoko kide bat zela. Thiomargarita magnifica izena jarri zioten (magnifica, itxura bikaina zuelako).
Horrela aurkitu zen T. magnifica bakterioa 2009an, baina zelula-egitura zehatza eta hari lotutako informazioa ez zeuden eskuragarri duela gutxi arte, Volland et al.-ek idatzitako "A centimeter-long bacterium with DNA contained in metabolically active, membrane-bound organelles" izeneko artikulu bat 2022ko ekainaren 23an argitaratu zen arte (aurre-inprimaketa bertsioa 2022ko otsailaren 22an argitaratu zen).
Ikerketa honen arabera, Thiomargarita magnifica zentimetro bateko luzera duen bakterio-zelula bakarra da. 2 mikrometro inguruko luzera duten bakterio gehienek ez bezala (bakterio batzuk 750 mikrometrokoak izan daitezke), Thiomargarita magnificaren zelula-luzera batez beste 9000 mikrometro baino handiagoa da. Horrek ezagutzen den bakteriorik handiena bihurtzen du. Jakina, begi hutsez argi ikusten da. Ordena honetako zelulen tamaina oso ezohikoa da prokariotoentzat.
Gainera, T. magnifica DNA mintzez lotutako bakterioen zelula-organulu mota berri batean dago. Hau esanguratsua da, zelularen barruko mintzez lotutako konpartimentu batean DNAren paketatzea eukariotoen ezaugarri garrantzitsutzat jotzen baita . Egileek pepina izena proposatu dute material genetikoa duen bakterioen zelula-organulu honi. Gainera, T. magnifica-k poliploidia maila altua erakusten du genoma handi batekin. Normalean, prokariotoek ez dute barne-mintzez lotutako organulurik zelulan eta material genetiko kantitate txikia dute. Ez dute T. magnifica-k bezala garapen-ziklo dimorfikorik erakusten.
Prokariotoak (bakterioak eta arkeoak) normalean organismo zelulabakar txikiak dira. Ez dute nukleo eta bestelako organulu ondo definiturik zeluletan. Egitura nahiko sinplea dute. Goian aipatutako ezaugarrietatik ikusten den bezala, T. magnifica zelula eukarioto bihurtuz konplexutasun maila handia hartu duela dirudi . Honek prokariotoaren ideia tradizionala zalantzan jartzen duela dirudi.
***
References:
- Volland JM, et al 2022. Zentimetro luzeko bakterioa, metabolikoki aktibo eta mintzetara loturiko organuluetan dagoen DNA duena. ZIENTZIA. 23ko ekainaren 2022an argitaratua. 376. liburukia, 6600. alea 1453-1458 or. DOI: https://doi.org/10.1126/science.abb3634 (Aurreinprimaketa bioRxiv-en. Zentimetro luzeko bakterioa, mintzarekin loturiko organuluetan konpartimentatutako DNA duena. 18ko otsailaren 2022an argitaratua. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.02.16.480423)
- Berkeley Lab 2022. Guadalupeko mangladietan aurkitutako bakterio erraldoiak erronka tradizionalaren kontzeptuak. Albiste Oharra Hedabideen Harremanak (510) 486-5183. 23ko ekainaren 2022a. Sarean eskuragarri https://newscenter.lbl.gov/2022/06/23/giant-bacteria-found-in-guadeloupe-mangroves-challenge-traditional-concepts/
***
(Aitorpena: K. Vasdev irakaslea bakterioen karakterizazio filogenetikoari buruzko ekarpen baliotsuagatik)
