Human Proteome Project (HPP): kaleratu den giza proteomaren % 90.4 estaltzen duen planoa

Giza Proteomaren Proiektua (HPP) 2010ean jarri zen abian Giza Genomaren Proiektua (HGP) arrakastaz amaitu ondoren, giza proteoma ( giza genomak adierazten dituen proteina multzo osoa ) identifikatu, karakterizatu eta mapatzeko . Hamargarren urteurrenean, HPP-k giza proteomaren % 90.4 hartzen duen lehen zorrotztasun handiko zirriborroa kaleratu du . Bizitzaren kodea denez, mugarri honek ondorio oso garrantzitsuak ditu gizakien osasunean eta terapietan.

2003an amaituta, Giza Genomaren Proiektua (HGP) 1990ean sortutako nazioarteko lankidetza bat izan zen, giza geneen multzo osoa identifikatzeko eta giza genomaren DNA baseen sekuentzia osoa zehazteko helburuarekin . 2001eko urtarrilaren 15ean, HGP-k giza genomaren hasierako sekuentzia eta analisia argitaratu zituen. Giza proteomaren (genomak kodetutako proteinen multzo osoa) identifikatzea, karakterizatzea eta mapatzea izan zen hurrengo urrats logikoa. Hori dela eta, Giza Proteomaren Erakundea (HUPO) sortu zen 2001eko otsailaren 9an proteomikaren ikerketa sustatzeko. 2010eko irailaren 23an, HUPO-k ofizialki abiarazi zuen Giza Proteomaren Proiektua (HPP), giza proteomaren plano bat prestatzeko helburuarekin ⁽¹⁾.

Giza genomaren analisiak 20,300 proteina kodetzaile gene inguru aurreikusten ditu. Gene hauek kodetutako proteinen multzo osoak osatzen du " giza proteoma". Giza proteoma "giza genoma" baino askoz handiagoa da, gene bat hainbat formatan (proteoformak) adieraz daitekeelako itzulpenean zehar eta ondoren gertatzen diren aldaketa kimikoen ondorioz. Kalkulatzen da milioi bat proteoforma bizi daitezkeela banako bakar batean. 2010ean, HPPren hasieran, genomaren analisiak aurreikusitako proteinen % 70 baino ez ziren identifikatu. Proteoma proiektuaren helburua ezagutza hutsune hori betetzea zen. Teknologiaren aurrerapenekin, proteinak eta haien formak zehaztasun handiagoz detektatu eta kuantifikatzea posible bihurtu da. Hala ere, falta diren proteina kopuru handia dago ( genomaren analisiak aurreikusitako proteinak , baina oraindik detektatu gabeak) ^(2,3) . Proiektua oraindik martxan dago; hala ere, mugarri bat lortu da.

2020ko urriaren 16an, bere hamargarren urteurrenean, HPP-k giza proteomaren % 90.4 hartzen duen lehen zorrotztasun handiko zirriborroa kaleratu zuen ⁽¹⁾ . Horrek nabarmen hobetzen du giza biologiari buruzko gure ezagutza eta mekanismo molekularren ulermena maila zelularrean eta molekularrean, batez ere giza proteomak jokatzen duen eginkizuna, eta horrek zuzenean eragiten du minbiziaren, gaixotasun kardiobaskularren eta infekziosoen diagnostiko eta terapien ikerketa eta garapena egitera, batez ere medikuntza pertsonalizatu eta zehatzerako ⁽⁴⁾.

Giza Proteinen Atlasaren garapenak aurrerapen oso esanguratsua dakar gizakien diagnostiko eta terapiaren arloko ikerketa gehiagorako ^(5,6).

***

References:

1. HUPO 2021. Proteomics Timeline. Eskuragarri https://hupo.org/Proteomics-Timeline.  

2. neXtProt 2021. Giza proteoma. Sarean eskuragarri https://www.nextprot.org/about/human-proteome 30ko abenduaren 2020ean sartu zen. 

3. Inserm, 2020. Proteomika: bizitzaren kodea %90 baino gehiago itzulia. 07ko abenduaren 2020an argitaratua. Sarean eskuragarri https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 30ko abenduaren 2020ean sartu zen.  

4. Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et al. 2020. Giza proteomaren zorroztasun handiko planoa. Argitaratua: 16ko urriaren 2020a. Nature Communication 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9  

5. Digre A. eta Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas - Giza proteomaren lokalizazioa espaziala osasunean eta gaixotasunean. Protein Science 30. alea, 1. alea. Lehenengo argitalpena: 04ko azaroaren 2020a. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987  

6. Giza Proteinen Atlasa 2020. Giza Proteinen Atlasa Sarean eskuragarri dago https://www.proteinatlas.org/about 30ko abenduaren 2020ean sartu zen. 

***