Human Proteome Project (HPP): kaleratu den giza proteomaren % 90.4 estaltzen duen planoa

Giza Proteome Proiektua (HPP) 2010ean abiarazi zen arrakastaz amaitu ondoren Giza Genoma Proiektua (HGP) identifikatzeko, karakterizatzeko eta mapatzeko giza proteoma (proteina multzo osoa giza genoma). Bere hamargarren urteurrenean, HPP-k zorroztasun handiko lehen planoa kaleratu du, % 90.4 hartzen duena. giza proteoma. Bizitzaren kodea den heinean, mugarri honek ondorio oso esanguratsuak ditu giza osasuna eta terapeutikoa.   

2003 osatuta, Giza Genome Project (HGP) 1990ean sortutako nazioarteko lankidetza bat izan zen. giza geneak eta DNA baseen sekuentzia osoa zehazteko giza genoma. 15eko urtarrilaren 2001ean, HGPk hasierako sekuentzia eta analisia kaleratu zituen giza genoma. Identifikatzea, karakterizatzea eta mapatzea giza proteoma (genomak kodetutako proteinen osagarri osoa) izan zen hurrengo urrats logikoa. Horregatik, Giza Proteome Organization (HUPO) 9eko otsailaren 2001an sortu zen proteomika ikerketa sustatzeko. 23eko irailaren 2010an HUPO ofizialki abian jarri zen Giza Proteome Project (HPP) proiektuaren plano bat prestatzeko helburuarekin giza proteoma ⁽¹⁾.  

Azterketaren giza genoma proteinak kodetzen dituzten 20,300 gene inguru aurreikusten ditu. Gene hauek kodetutako proteina multzo osoak osatzen dute.giza proteoma'. Giza proteoma "giza genoma" baino askoz ere handiagoa da, gene bat hainbat formatan (proteoformak) adieraz daitekeelako, itzulpenean zehar eta ondoren aldaketa kimikoen ondorioz. Gizabanako bakarrean milioi bat proteoforma elkarrekin egon daitezkeela kalkulatzen da. 2010ean, HPPren hasieran, genomaren analisiak aurreikusitako proteinen % 70 apenas identifikatu ziren. Proteoma proiektuaren agenda ezagutza hutsune hori betetzea zen. Teknologiaren aurrerapenekin, proteinak eta haien formak zehaztasun handiagoz detektatu eta kuantifikatzea posible egin da. Hala ere, proteina asko falta dira (proteinak genomaren analisiak aurreikusi, baina oraindik detektatu gabe) ^(2,3). Proiektua martxan dago oraindik; hala ere, mugarri bat lortu da. 

16ko urriaren 2020an bere hamargarren urteurrenean, HPPk giza proteomaren % 90.4 estaltzen duen zorroztasun handiko lehen planoa kaleratu zuen. ⁽¹⁾. Horrek nabarmen hobetzen du giza biologiari buruzko ezagutza eta mekanismo molekularren ulermena maila zelularrean eta molekularrean, batez ere giza proteomak betetzen duen papera zuzenean minbiziaren, gaixotasun kardiobaskularren eta infekziosoen diagnostiko eta terapeutikoen ikerketa eta garapena burutzen duena, bereziki pertsonalizatu eta pertsonalizatuetarako. doitasun medikuntza ⁽⁴⁾. 

Gizakiaren garapena Protein Atlas-ek oso aurrerapen esanguratsu bat aurkezten du gizakiaren diagnostiko eta terapeutikoaren alorrean ikerketa gehiago egiteko ^(5,6).  

***

References:

1. HUPO 2021. Proteomics Timeline. Eskuragarri https://hupo.org/Proteomics-Timeline.  

2. neXtProt 2021. Giza proteoma. Sarean eskuragarri https://www.nextprot.org/about/human-proteome 30ko abenduaren 2020ean sartu zen. 

3. Inserm, 2020. Proteomika: bizitzaren kodea %90 baino gehiago itzulia. 07ko abenduaren 2020an argitaratua. Sarean eskuragarri https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 30ko abenduaren 2020ean sartu zen.  

4. Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et al. 2020. Giza proteomaren zorroztasun handiko planoa. Argitaratua: 16ko urriaren 2020a. Nature Communication 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9  

5. Digre A. eta Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas - Giza proteomaren lokalizazioa espaziala osasunean eta gaixotasunean. Protein Science 30. alea, 1. alea. Lehenengo argitalpena: 04ko azaroaren 2020a. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987  

6. Giza Proteinen Atlasa 2020. Giza Proteinen Atlasa Sarean eskuragarri dago https://www.proteinatlas.org/about 30ko abenduaren 2020ean sartu zen. 

***