RNA ligasek paper garrantzitsua betetzen dute RNA konponketan, eta horrela RNAren osotasuna mantentzen dute. RNAren konponketan edozein matxura gizakiak neurodegenerazioa eta minbizia bezalako gaixotasunekin lotuta dagoela dirudi. Nobela baten aurkikuntza giza proteina (C12orf29 12. kromosoman) RNA ligasa gisa, beraz, garrantzitsua da gaixotasun horietarako tratamendu berrien garapenean. Ikertzaileek hau izena jartzea proposatu dute proteina Homo sapiens RNA ligasa (HsRnl) gisa.
Ligase bat da entzima normalean hidrolisi bidez bi azido nukleiko molekulen elkartzea edo lotzea katalizatzen duena. Adibidez, DNA ligasak elkartzea errazten du DNA kateak fosfodiester loturaren eraketa katalizatuz, eta, ondorioz, funtsezko papera betetzen dute genomaren osotasuna mantentzen DNAren erreplikazio, birkonbinazio eta konponketa prozesuan organismoaren bizitza osoan zehar. Era berean, RNA ligasak 3′-OH eta 5′-P taldeen arteko fosfodiester loturak sortzea katalizatzen du. RNA molekulak. Beraz, funtsezko papera betetzen du RNA sasoi zelularra konpontzea eta mantentzea.
The aurkikuntza C12orf29-a AMPylated (Adenosina Mono Fosforilatua) identifikatzen zen bitartean gertatu zen proteinak proteomika kimikoaren ikuspegiaren bidez1. AMPilazioak AMParen atxikimendu kobalentea dakar proteina alboko kateak fosfodiester loturen bidez, zeinetan ATP-k kosubstratu gisa jokatzen du. The proteina 37 kDa-ko tamaina du eta 325 aminoazidoz osatuta dago. Harrigarria bada ere, goialdean oso kontserbatuta dago eukariotoetan baina behean ez dago eukariotoetan hala nola legamia. Analisi funtzionalak 5'-3' zeudela erakutsi zuen RNA ligasaren jarduera. Mutazio-analisiak agerian utzi zuen D59N, R77L, E123D eta K263N mutazioei erreferentzia egiten dieten zenbait hondakinen aldaketak aurkitu zirela, hurrenez hurren, esofagiko zelula ezkatsuetako kartzinoma, glioblastoma, leuzemia linfozitiko kronikoa eta obulutegiko zistadenokartzinoma serosa pairatzen zuten pazienteetan. Goiko 3 mutazio guztiek E123D izan ezik, kalteak eragiten dituzte RNA ligatzea.
Knock out C12orf29 HEK293-n (giza enbrioiaren giltzurrun) zelulek zelulak ahultasuna eragiten dute oxigeno-espezie erreaktiboekiko proteina paper garrantzitsua jokatzen du kalteak konpontzeko RNA oxigeno-espezie erreaktiboak sortzeak eragindakoa1. Nobela honen identifikazioa proteinaizeneko HsRnl (Homo sapiens RNA ligase), terapeutika berrien garapenean hainbat ondorio ditu narriadura gisa RNA konponketa barruan gizakiak neurodegenerazioa bezalako hainbat gaixotasunen agerpenarekin lotzen da eta minbiziar2, 3.
***
References:
- Yuan Y., et al 2022. A giza RNA auto- eta bidez funtzionatzen duen ligase RNA-AMPilazioa. bioRxiv aurreinprimaketa. 19ko abuztuaren 2022an argitaratua. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.07.18.500566
- Burroughs AM & Aravind L. RNA kalteak gatazka biologikoetan eta erantzuteko aniztasuna RNA konponketa sistemak. Azido Nukleikoak Res. 44, 8525-8555 (2016). https://doi.org/10.1093/nar/gkw722
- Yan, LL eta Zahner, HS Zelulek nola egiten diote aurre RNA kalteak eta bere ondorioak? J. Biol. Kim. 294, 15158-15171 (2019). DOI: https://doi.org/10.1074/jbc.REV119.006513
***
 as an RNA ligase, therefore, has relevance in development of novel treatments for such diseases. Researchers have proposed to name this protein as Homo sapiens RNA ligase (HsRnl).){kind=link}