Ikuspegi biologiko eta konputazionalaren konbinazio bat proteina-proteinen arteko elkarrekintzak (PPI) ikertzeko proteina birikoaren eta ostalariaren artean, sendagaiak identifikatzeko eta berriro erabiltzeko, COVID-19aren eta agian beste infekzio batzuen tratamendu eraginkorra lortzeko..
Infekzio birikoei aurre egiteko ohiko estrategiak birusen aurkako sendagaiak diseinatzea eta txertoak garatzea dira. Aurrekaririk gabeko egungo krisian, mundua jasaten ari da Covid-19 SARS-CoV-2k eragindakoa birus, aurreko bi ikuspegietatik ateratako emaitzak nahiko urrunak dirudite emaitza itxaropentsuak emateko.
Nazioarteko ikertzaile talde batek duela gutxi (1) ikuspegi berri bat hartu du (birusek ostalariekin elkarrekintzan duten moduan oinarrituta) garatzen ari diren sendagai berriak identifikatzen dituzten lehendik dauden sendagaiak "berriro" erabiltzeko, COVID-19 infekzioari eraginkortasunez aurre egiten lagun dezaketenak. SARS-CoV-2 gizakiekin nola elkarreragiten duen ulertzeko, ikertzaileek teknika biologiko eta konputazionalen konbinazio bat erabili zuten proteina birikoek gizakietan infekzioa eragiteko eta erabiltzen duten giza proteinen "mapa" sortzeko. Ikerketan erabilitako 300 proteina biralekin elkarreragina duten 26 giza proteina baino gehiago identifikatu ahal izan zituzten ikertzaileek (2). Hurrengo pausoa lehendik zeuden botikak zein garatzen ari zirenak izan zitezkeen identifikatzea izan zen.berrerabilia” COVID-19 infekzioa tratatzeko giza proteina horiei zuzenduta.
Ikerketak COVID-19 gaixotasuna modu eraginkorrean tratatu eta murrizteko moduko bi sendagai mota identifikatu zituen: zotatifina eta ternatin-4/plitidepsin barne, proteina-itzulpenaren inhibitzaileak eta Sigma1 eta Sigma 2 hartzaileen proteina modulatzeaz arduratzen diren sendagaiak. zelula barne, progesterona, PB28, PD-144418, hidroxiklorokina, haloperidol eta droga antipsikotikoak. cloperazina, siramesina, antidepresibo eta antsietatearen aurkako sendagaia, eta clemastine eta cloperastine antihistaminikoak.
Proteinen itzulpenaren inhibitzaileen artean, COVID-19ren aurkako in vitro efektu antibiral indartsuena zotafinarekin ikusi zen, gaur egun minbiziaren aurkako saiakuntza klinikoetan dagoena, eta ternatin-4/plitidepsinarekin, FDAk mieloma anizkoitzaren tratamendurako onartua izan dena.
Sigma1 eta Sigma2 hartzaileak modulatzen dituzten botiken artean, eskizofrenia tratatzeko erabiltzen den haloperidol antipsikotikoak SARS-CoV-2-ren aurkako birusaren aurkako jarduera erakutsi zuen. Bi antihistaminiko indartsuek, clemastina eta cloperastina, birusen aurkako jarduera ere erakutsi zuten, PB28k bezala. PB28-k erakutsitako birusen aurkako efektua hidroxiklorokina baino 20 aldiz handiagoa izan zen. Hidroxiklorokinak, berriz, erakutsi zuen, Sigma1 eta -2 errezeptoreetara bideratzeaz gain, hERG izenez ezagutzen den proteinarekin ere lotzen dela, bihotzeko jarduera elektrikoa erregulatzeagatik ezaguna dena. Emaitza hauek hidroxiklorokina eta bere deribatuak COVID-19rako terapia potentzial gisa erabiltzearekin lotutako arrisku posibleak azaltzen lagun dezakete.
Aipatutako in vitro ikerketek emaitza itxaropentsuak eman dituzten arren, "budinaren froga" sendagai molekula potentzial horiek entsegu klinikoetan nola ateratzen diren eta COVID-19rako laster tratamendu onartu bat ekarriko dutenaren araberakoa izango da. Azterketaren berezitasuna birusak ostalariarekin nola elkarreragiten duen gure ezagutza zabaltzen duela da, proteina birikoekin elkarreragiten duten giza proteinak identifikatzea eta ingurune biral batean aztertzea agerikoak ez liratekeen konposatuak ezagutzera emanez.
Ikerketa honek agerian utzitako informazio honek ez die zientzialariei lagundu sendagai itxaropentsuak azkar identifikatzen entsegu klinikoak egiteko, baizik eta klinikan dagoeneko gertatzen ari diren tratamenduen eragina ulertzeko eta aurreikusteko erabil daiteke, eta sendagaien aurkikuntzarako ere hedatu daiteke beste batzuen aurka. gaixotasun birikoak eta ez-birikoak.
***
References:
1. The Institut Pasteur, 2020. SARS-COV-2k giza zelulak nola bahitzen dituen agerian utziz; COVID-19ari aurre egiteko potentziala duten sendagaiak eta haren hazkuntza infekziosoak laguntzen dituen sendagaiak adierazten ditu. PRENTSA Oharra 30ko apirilaren 2020ean argitaratua. Sarean eskuragarri https://www.pasteur.fr/en/research-journal/press-documents/revealing-how-sars-cov-2-hijacks-human-cells-points-drugs-potential-fight-covid-19-and-drug-aids-its 06ko maiatzaren 2020an sartuta.
2. Gordon, DE et al. 2020. SARS-CoV-2 proteina-interakzio-mapa batek drogak berriro erabiltzeko helburuak erakusten ditu. Natura (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-020-2286-9
***
 between the viral and the host proteins in order to identify and repurpose drugs for an effective treatment of COVID-19 and possibly other infections as well.){kind=link}
Erantzunak itxita daude.